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中國發(fā)展門戶網(wǎng)8月11日電 日前,中國科學(xué)院編寫了《中國科學(xué)院信息化發(fā)展報告2011》,在其中介紹了國外科研信息化基礎(chǔ)設(shè)施發(fā)展現(xiàn)狀。具體內(nèi)容如下:
從當(dāng)前世界各國和地區(qū)的科研信息化基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)來看,其重點主要集中于高速網(wǎng)絡(luò)、分布式計算設(shè)施、高性能計算、科學(xué)數(shù)據(jù)管理等四大緊密相連的領(lǐng)域。
1.高速科研專用網(wǎng)絡(luò)建設(shè)如火如荼
寬帶網(wǎng)絡(luò)尤其是科研專用網(wǎng)絡(luò),支撐著一切基于網(wǎng)絡(luò)的科研信息化活動。當(dāng)前世界各國都在競相開展高端科研教育網(wǎng)絡(luò)建設(shè)。目前,全球大規(guī)模學(xué)術(shù)網(wǎng)基本可分為三大主體:歐盟的GéANT、北美的Internet2和亞太地區(qū)先進網(wǎng)絡(luò)APAN。
(1)GéANT:世界最大的多千兆教育科研專用計算機網(wǎng)絡(luò)由歐盟委員會和歐洲各國科研教育網(wǎng)(NRENs)聯(lián)合資助興建的高帶寬泛歐科研教育骨干網(wǎng)GéANT 是歐盟e-Infrastructure戰(zhàn)略的核心。它既是專門支持科研信息化的全球科研網(wǎng)絡(luò)的核心,也是未來互聯(lián)網(wǎng)各項核心技術(shù)研發(fā)的基礎(chǔ)。GéANT目前連接著全歐32個國家科研教育網(wǎng)(NRENs)和全球類似網(wǎng)絡(luò),可為40個歐洲國家約8,000家科研院所的4,000萬科研教育用戶提供無縫連接的服務(wù),是世界最大、最先進與多樣化的科研教育網(wǎng)絡(luò)體系 。
圖表 1. GéANT網(wǎng)絡(luò)全球連接示意圖
(2)Internet2
Internet2已成為最前沿研發(fā)和實驗的平臺,可滿足其成員對協(xié)作應(yīng)用、分布式研究實驗、基于網(wǎng)格的數(shù)據(jù)分析和社會聯(lián)網(wǎng)等帶寬密集型處理的需求 。2010年夏,美國政府撥款6250多萬美元,資助Internet2和其他幾家國家科研教育網(wǎng)絡(luò)建造帶寬100G的美國統(tǒng)一社區(qū)錨點網(wǎng)(U.S.UCAN),以連接美國的學(xué)校、圖書館、社區(qū)大學(xué)、保健中心和公共安全組織等社區(qū)機構(gòu),實現(xiàn)當(dāng)前典型互聯(lián)網(wǎng)服務(wù)尚未包括的先進應(yīng)用 。2010年10月,NSF又為Internet2中間件計劃提供了為期3年約265萬美元的資助,旨在將Internet2開發(fā)的基本認(rèn)證軟件組合為一個工具包,以促進虛擬組織的協(xié)作 。
(3)亞太地區(qū)先進網(wǎng)絡(luò)APAN
亞太地區(qū)先進網(wǎng)絡(luò)APAN 聯(lián)盟成立于1997年,旨在為亞太地區(qū)科研教育團體提供一個先進的網(wǎng)絡(luò)環(huán)境并協(xié)調(diào)其發(fā)展,推進網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用和服務(wù)。澳大利亞學(xué)術(shù)與研究網(wǎng)AARNet、日本學(xué)術(shù)信息網(wǎng)SINET3和我國的CERNET網(wǎng)絡(luò)是亞太地區(qū)科研教育網(wǎng)的主要組成部分。
與上述網(wǎng)絡(luò)相連構(gòu)成全球科研教育龐大網(wǎng)絡(luò)體系的主要國際科研教育網(wǎng)還包括:美國能源科學(xué)網(wǎng)絡(luò)ESnet、荷蘭國家教育科研網(wǎng)絡(luò)SURFnet、法國國家科研教育網(wǎng)絡(luò)RENATER、加拿大的CA*net4、跨歐亞信息網(wǎng)絡(luò)TEIN3、東南歐的SEEREN,地中海地區(qū)的EUMEDCONNECT,拉丁美洲的ALICE,印度的ERNET,中亞與高加索地區(qū)的OCCASION,南非的TENET,連接我國和歐洲的ORIENT等。
2.科學(xué)數(shù)據(jù)及其應(yīng)用管理備受矚目
現(xiàn)代科學(xué)與工程中,幾乎所有領(lǐng)域的數(shù)據(jù)量每年都在成倍增長,其分析應(yīng)用也愈發(fā)復(fù)雜,不同形式的數(shù)據(jù)均需得到妥善的管理、存儲、維護,并通過用戶友好的信息化基礎(chǔ)設(shè)施服務(wù)提供給所有的科學(xué)團體使用,科學(xué)數(shù)據(jù)資源及應(yīng)用環(huán)境已納入科研信息化環(huán)境的基礎(chǔ)設(shè)施范疇 。
(1)美國的DataNet計劃
美國政府歷來對科學(xué)數(shù)據(jù)工作極為重視,NSF于2007年9月正式發(fā)布了科學(xué)數(shù)據(jù)可持續(xù)保存與共享網(wǎng)絡(luò)伙伴計劃(Sustainable Digital Data Preservation and Access Network Partners, DataNet)項目指南 ,規(guī)劃創(chuàng)建面向科研信息化的科學(xué)數(shù)據(jù)保存與共享模式。在此項目支持下,NSF預(yù)計未來五年(2009年開始)投資1億美元,建立一批全景示范的新型數(shù)據(jù)保存與共享組織架構(gòu),為長期的科學(xué)研究提供可靠的數(shù)據(jù)保存、訪問、集成和分析能力,以及預(yù)測及不斷適應(yīng)技術(shù)本身及用戶需求所帶來的變化等。
DataNet項目資助成立的虛擬組織“數(shù)據(jù)管理委員會”(The Data Conservancy)主要負(fù)責(zé)研發(fā)可支持科學(xué)數(shù)據(jù)保存、應(yīng)用和安全的數(shù)據(jù)收藏基礎(chǔ)設(shè)施,其在靈活獲取數(shù)據(jù)、開展與開放數(shù)據(jù)相關(guān)的活動和拒絕使用來源不明的數(shù)據(jù)方面都取得了一定成效 。
(2)英國DISC-UK數(shù)據(jù)共享項目
由英國多家機構(gòu)聯(lián)合開展的DISC-UK數(shù)據(jù)共享項目(2007.3-2009.3)的總體目標(biāo)是在一個復(fù)雜和動態(tài)的信息環(huán)境中促進學(xué)術(shù)數(shù)據(jù)共享新模式、工作流程和工具的形成。其利用各方專業(yè)知識,推進數(shù)據(jù)存放服務(wù),探索新途徑,協(xié)助研究人員在互聯(lián)網(wǎng)上分享數(shù)據(jù)。
2009年5月15日,DISC-UK數(shù)據(jù)共享項目最終報告發(fā)布 ,總結(jié)了近期英國科學(xué)數(shù)據(jù)共享研究的重要進展與特點并得出三個重要結(jié)論:①對研究人員而言,數(shù)據(jù)管理比數(shù)據(jù)共享更能成為使用知識庫的動機,但還不足以產(chǎn)生文化變革;②數(shù)據(jù)館員、數(shù)據(jù)管理人員和數(shù)據(jù)科學(xué)家可以幫助知識庫管理人員和研究人員開展交流;③機構(gòu)知識庫可以提高在互聯(lián)網(wǎng)上共享數(shù)據(jù)的影響力。
(3)澳大利亞科研數(shù)據(jù)共享基礎(chǔ)設(shè)施(ARDC)澳大利亞政府從2008年啟動建設(shè)國家科學(xué)數(shù)據(jù)服務(wù)網(wǎng)絡(luò)(Australian National Data Service,ANDS) ,旨在全面整合全國數(shù)據(jù)資源,實現(xiàn)數(shù)據(jù)長期保存和共享利用。2009年,澳大利亞高等教育投資基金(EIF)撥款4800萬澳元,支持ANDS創(chuàng)建和發(fā)展“澳大利亞科研數(shù)據(jù)共享(Australian Research Data Commons,ARDC)”基礎(chǔ)設(shè)施 ,旨在使澳大利亞科研數(shù)據(jù)作為一個整體,成為一項國家性的戰(zhàn)略資源。其重點領(lǐng)域包括:數(shù)據(jù)采集基礎(chǔ)設(shè)施、元數(shù)據(jù)存儲基礎(chǔ)設(shè)施、自動數(shù)據(jù)發(fā)布公共基礎(chǔ)設(shè)施、ARDC核心基礎(chǔ)設(shè)施和ARDC軟件基礎(chǔ)設(shè)施。
?3.高性能計算成為評估國家創(chuàng)新能力的關(guān)鍵
高性能計算設(shè)施對現(xiàn)代科學(xué)研究而言是一種極為重要且不可或缺的戰(zhàn)略工具,世界各國都對超級計算能力建設(shè)和應(yīng)用高度重視,紛紛提出國家級計劃。超級計算的能力和應(yīng)用水平已經(jīng)成為評價國家創(chuàng)新能力和國家競爭力的關(guān)鍵因素之一。
(1)歐洲的PRACE計劃與DEISA計劃
2010年6月9日,耗資4億歐元、有20個國家參與、聯(lián)接多臺超級計算機、每秒計算速度將達百萬兆次的歐洲先進計算合作伙伴(Partnership for Advanced Computing in Europe ,PRACE)計劃在西班牙巴塞羅那正式啟動。從2011年到2015年,德國、法國、意大利和西班牙的超級計算機將逐步聯(lián)接在一起,并計劃至2019年將運算速度提升到每秒百億億次。目前歐洲計算速度最快的德國Jugene超級計算機將成為新合作平臺的首臺Tier-0系統(tǒng)供歐洲科研人員使用 ,而采用了平衡模塊架構(gòu)的第二臺Tier-0系統(tǒng)“居里(Curie)”也于近日確定在法國部署 。
與PARCE計劃緊密相連的歐洲超級計算應(yīng)用分布式架構(gòu)(Distributed European Infrastructure or Supercomputing Applications,DEISA)計劃 致力于促進世界水平的泛歐計算科學(xué)研究,為部署合作型歐洲超級計算機的高性能計算生態(tài)系統(tǒng)鋪平道路。DEISA是建立在歐洲各國現(xiàn)有國內(nèi)服務(wù)之上的歐洲超級計算服務(wù),可提供網(wǎng)絡(luò)管理和支持、Global文件系統(tǒng)數(shù)據(jù)管理、DEISA運轉(zhuǎn)、資源管理、應(yīng)用及用戶支持、關(guān)鍵運用的實施、安全應(yīng)用等服務(wù)。
(2)美國能源部先進科學(xué)計算研究(ASCR)計劃
ASCR計劃由美國能源部科學(xué)辦公室資助 ,主要任務(wù)是為能源安全、核安全、科學(xué)發(fā)現(xiàn)和創(chuàng)新、環(huán)境等科學(xué)領(lǐng)域的研究人員開發(fā)和部署計算與網(wǎng)絡(luò)工具,使其能對復(fù)雜現(xiàn)象進行分析、建模和預(yù)測,對原本因危險性和成本過高而無法進行的實驗進行驗證。ASCR主導(dǎo)的跨學(xué)科項目包括:基于先進計算的科學(xué)發(fā)現(xiàn)(SciDAC)項目、理論與實驗創(chuàng)新計算項目(INCITE)項目和多尺度數(shù)學(xué)行動計劃(MMI)。
2010年初,INCITE項目宣布為69項涉及鋰空氣電池、納米太陽能電池、核燃料循環(huán)、先進推進系統(tǒng)、DNA測序、納米結(jié)構(gòu)超導(dǎo)材料的微尺度現(xiàn)象的尖端研究分配約160億CPU小時的超級計算時間,支持他們?nèi)〉猛黄菩赃M展 ,而能源、環(huán)境、氣候變化和生物學(xué)是其中重點。
(3)日本下一代超級計算機戰(zhàn)略領(lǐng)域
2009年7月22日,日本下一代超級計算機戰(zhàn)略委員會確定了五大下一代超級計算機戰(zhàn)略領(lǐng)域及其在未來五年內(nèi)擬實現(xiàn)的目標(biāo)和預(yù)期成果 。包括:①預(yù)測生命科學(xué)、醫(yī)療及制藥基礎(chǔ)領(lǐng)域;②新物質(zhì)和新能源開發(fā);③災(zāi)害現(xiàn)象及全球變化情況預(yù)測;④設(shè)計下一代新產(chǎn)品,對產(chǎn)品進行優(yōu)化組合,模擬評價產(chǎn)品性能和壽命等;⑤物質(zhì)與宇宙的起源與構(gòu)造研究。
4.分布式計算基礎(chǔ)設(shè)施開創(chuàng)全新科研合作模式
分布式計算基礎(chǔ)設(shè)施,或者說網(wǎng)格,被認(rèn)為是繼傳統(tǒng)Internet、Web之后的第三次浪潮。它逐漸改變了人們使用計算機及其相連設(shè)備的方式,為全球合作研究提供了新的途徑。通過網(wǎng)格技術(shù),人們可以將高速互聯(lián)網(wǎng)、高性能計算機、大型數(shù)據(jù)庫、傳感器、遠(yuǎn)程設(shè)備等融為一體,將分散在不同地理位置的電腦組織成一臺“虛擬的超級計算機”,實現(xiàn)計算、存儲、數(shù)據(jù)、信息、軟件、知識和專家等資源的全面共享。
(1)歐洲網(wǎng)格基礎(chǔ)設(shè)施項目(EGI)
2010年,歐盟啟動了新的網(wǎng)格建設(shè)項目——歐洲網(wǎng)格基礎(chǔ)設(shè)施(European Grid Infrastructure,EGI) ,試圖在當(dāng)前世界最大的多科學(xué)網(wǎng)格“歐洲科研信息化網(wǎng)格”(Enabling Grids for e-Science,EGEE)的基礎(chǔ)上,建立一個基于國家網(wǎng)格計劃(NGI)的協(xié)作型泛歐網(wǎng)格基礎(chǔ)設(shè)施,以滿足不同學(xué)科對計算資源的需求。
(2)美國的TeraGrid XD項目
TeraGrid項目 于2001年8月由美國國家科學(xué)基金會(NSF)投資4500萬美元啟動,旨在構(gòu)建全球范圍最廣、功能最全面、支持開放式科學(xué)研究的分布式網(wǎng)格計算體系。TeraGrid項目于2010年結(jié)束,其后續(xù)項目XD項目將于2011年4月1日啟動,并持續(xù)至2016年5月30日。XD項目 旨在建設(shè)一個能提供高端數(shù)字服務(wù)的網(wǎng)絡(luò)基礎(chǔ)設(shè)施,通過為科研教育人員提供可用的、超越一般程度的超級數(shù)字資源以及相關(guān)界面、建議和培訓(xùn),使科學(xué)和工程研究、科研和教育的融合、科學(xué)與工程研究合作范圍擴展等領(lǐng)域的工作取得重大進展。
(3)開放科學(xué)網(wǎng)格項目
美國開放科學(xué)網(wǎng)格(Open Science Grid,OSG)是由來自全美各所大學(xué)、國家實驗室和計算中心的軟件、服務(wù)和資源供應(yīng)商共同組成的聯(lián)盟,旨在滿足所有層次的科學(xué)虛擬組織當(dāng)前和未來的需求。OSG項目截至日期為2011年,其功能包括 :
①利用一套通用的中間件,將大學(xué)和研究團體的計算與存儲資源集中放置到一個通用、共享的網(wǎng)格基礎(chǔ)設(shè)施之上;
②使參與的研究團體能以低成本的方式訪問更多的資源;
③OSG虛擬數(shù)據(jù)工具包可為參與的計算和存儲節(jié)點提供相應(yīng)的、經(jīng)測試的支持軟件包,并為終端科研用戶提供客戶端軟件包;
④與科研團體通力合作,幫助他們評估自身網(wǎng)絡(luò)基礎(chǔ)設(shè)施需求并針對本地、國家和國際需求規(guī)劃解決方案。
5.云計算日益成為科研信息化的一大支柱
云計算作為未來發(fā)展的重要趨勢,已經(jīng)引起科學(xué)界的高度重視。隨著云計算的不斷進步與完善,有許多科研機構(gòu)開始積極嘗試?yán)迷朴嬎銖氖驴蒲泄ぷ鳎⑶乙颜Q生不少成功案例,有人將這類云計算稱為“科學(xué)云”(Science Cloud)。
(1)云計算大幅降低了生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)的研究成本生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)是云計算應(yīng)用的兩大熱點領(lǐng)域。云計算可以解決生命科學(xué)和醫(yī)學(xué)研究成本過高的難題。例如,美國威斯康星醫(yī)學(xué)院生物技術(shù)與生物工程中心開發(fā)出一套名為ViPDAC(虛擬蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)分析集群)的免費軟件,與Amazon公司的云計算服務(wù)搭配使用,能夠讓全世界的科學(xué)家通過云計算分析蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù),并利用大量的計算資源提高數(shù)據(jù)分析速度,為那些目前沒有大量計算資源使用權(quán)限的研究人員提供了更多選擇,并極大降低了蛋白質(zhì)研究成本。美國約翰霍普金斯大學(xué)彭博公共衛(wèi)生學(xué)院開發(fā)的基于云計算的Myrna軟件,可在大幅提高RNA序列數(shù)據(jù)分析速度的同時降低成本 。此外,IBM公司也計劃與美國密蘇里大學(xué)聯(lián)合創(chuàng)建用于基因組學(xué)研究的云計算環(huán)境 。
在醫(yī)學(xué)研究方面,哈佛醫(yī)學(xué)院在美國Platform公司的幫助下建立了內(nèi)部云計算平臺,動態(tài)滿足了各部門的計算需求,并最大限度地降低了成本。其下一步的計劃是使用戶能通過內(nèi)部云使用到Amazon EC2等外部云計算平臺的資源。歐盟BEinGRID項目為癌癥放射療法開發(fā)了一套云計算解決方案,能以低成本提供更強大的軟硬件資源,方便醫(yī)院更好更快地獲取結(jié)果。這套云計算方案還可用于圖像引導(dǎo)放射治療、強子治療、近距離放射治療等。
(2)云計算有助于改善數(shù)據(jù)傳輸與科研模擬
美國伊利諾伊大學(xué)研制成功一套云計算系統(tǒng),可以通過高性能網(wǎng)絡(luò)將散布在各地數(shù)據(jù)中心的數(shù)據(jù)快速匯聚到一起,比同類系統(tǒng)的速度快6倍。美國華盛頓大學(xué)于2009年建立的面向海洋學(xué)和天文學(xué)研究的云計算網(wǎng)絡(luò)平臺可以處理容量巨大的數(shù)據(jù)集,進行海洋氣候模擬和天文圖片分析。而美國阿貢國家實驗室完成一種新型動態(tài)分布式科學(xué)計算云資源集成系統(tǒng),能幫助物理學(xué)家動態(tài)地獲取云計算資源,以開展重離子仿真工作。云計算有助于實現(xiàn)長期模擬,從中發(fā)現(xiàn)變化趨勢,并將相關(guān)信息展示在互聯(lián)網(wǎng)上。