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國(guó)際微生物大數(shù)據(jù)平臺(tái)的應(yīng)用與啟示

發(fā)布時(shí)間:2018-09-07 11:49:46  |  來(lái)源:中國(guó)網(wǎng)·中國(guó)發(fā)展門(mén)戶網(wǎng)  |  作者:劉柳 馬俊才  |  責(zé)任編輯:趙斌宇
關(guān)鍵詞:微生物資源,微生物大數(shù)據(jù),大數(shù)據(jù)平臺(tái),戰(zhàn)略資源

 

中國(guó)網(wǎng)/中國(guó)發(fā)展門(mén)戶網(wǎng)訊  微生物資源是人類賴以生存和發(fā)展的重要物質(zhì)基礎(chǔ),是生命科學(xué)和生物技術(shù)創(chuàng)新的重要源泉。隨著生物大數(shù)據(jù)時(shí)代的到來(lái),微生物及其基因資源數(shù)據(jù)也正呈現(xiàn)爆炸性增長(zhǎng),微生物學(xué)研究正從以數(shù)據(jù)為支撐逐漸向以數(shù)據(jù)為中心轉(zhuǎn)變,海量數(shù)據(jù)的整理整合和開(kāi)放共享對(duì)于微生物資源的研究和利用變得至關(guān)重要,微生物學(xué)已進(jìn)入了組學(xué)數(shù)據(jù)時(shí)代。

與微生物相關(guān)的數(shù)據(jù)資源建設(shè)方面,國(guó)內(nèi)許多單位已經(jīng)分別建立了近百個(gè)生物信息資源數(shù)據(jù)庫(kù),數(shù)據(jù)總量達(dá)到?PB?量級(jí)。在國(guó)家“863”計(jì)劃的支持下,我國(guó)生物信息技術(shù)與平臺(tái)管理技術(shù)體系已經(jīng)成熟。北京和上海建立了分布式的生命科學(xué)基礎(chǔ)公共信息分享平臺(tái),為國(guó)際公共數(shù)據(jù)庫(kù)的引進(jìn)、我國(guó)生物學(xué)基礎(chǔ)科學(xué)數(shù)據(jù)的共享、二次數(shù)據(jù)庫(kù)的開(kāi)發(fā)做了大量卓有成效的工作,使我國(guó)在分布式的生命科學(xué)基礎(chǔ)公共信息分享平臺(tái)建設(shè)奠定了良好基礎(chǔ)。

在大數(shù)據(jù)的背景下,未來(lái)的微生物學(xué)研究必將朝著形成一個(gè)全方位的微生物資源研究、開(kāi)發(fā)與應(yīng)用的網(wǎng)絡(luò)的方向發(fā)展,微生物研究各個(gè)環(huán)節(jié)的聯(lián)系更加緊密,但每個(gè)環(huán)節(jié)的深度也在不斷增加,對(duì)數(shù)據(jù)應(yīng)用必將提出更高的要求。隨著云技術(shù)的發(fā)展,為大規(guī)模的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、計(jì)算和多樣化的分析提供了很好的解決方案。因此,利用云技術(shù),為科學(xué)家提供既包括整合型的數(shù)據(jù),又能夠提供可定制數(shù)據(jù)分析服務(wù)的平臺(tái),也將是未來(lái)微生物學(xué)數(shù)據(jù)研究的一個(gè)重要趨勢(shì)。

微生物資源與微生物大數(shù)據(jù)是國(guó)家重要戰(zhàn)略資源

微生物作為最簡(jiǎn)單的生命體,蘊(yùn)藏著極為豐富的物種資源和基因資源,微生物豐富的生物多樣性也使其成為生物技術(shù)和生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展的基石,為人類解決能源、環(huán)境危機(jī)提供了重要平臺(tái)。目前可培養(yǎng)微生物僅占微生物資源的?1%,而且這些已培養(yǎng)的微生物菌種的利用程度也非常低;因此,微生物資源是一筆巨大的、尚未開(kāi)發(fā)的資源財(cái)富,開(kāi)發(fā)和利用微生物資源具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。微生物資源的有效利用是國(guó)民經(jīng)濟(jì)可持續(xù)發(fā)展不可或缺的條件之一,直接影響國(guó)家的未來(lái)經(jīng)濟(jì)發(fā)展?jié)摿Γ彩且粋€(gè)國(guó)家重要的戰(zhàn)略資源。美國(guó)、歐盟、日本等都將微生物資源的開(kāi)發(fā)與利用納入其戰(zhàn)略發(fā)展規(guī)劃,并圍繞微生物資源的發(fā)掘利用和產(chǎn)業(yè)開(kāi)發(fā)等主題進(jìn)行了中長(zhǎng)期的部署。

微生物數(shù)據(jù)資源是微生物資源共享和開(kāi)發(fā)的關(guān)鍵環(huán)節(jié),數(shù)據(jù)資源的豐富性、準(zhǔn)確性和共享水平?jīng)Q定著整個(gè)微生物學(xué)領(lǐng)域研究和應(yīng)用的綜合能力。與實(shí)物資源相比,微生物數(shù)據(jù)資源是最有可能實(shí)現(xiàn)共享的一種資源。通過(guò)信息技術(shù),建立統(tǒng)一的數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),為微生物資源研究的各個(gè)環(huán)節(jié)提供包括數(shù)據(jù)管理及共享、數(shù)據(jù)分析、計(jì)算模型等在內(nèi)的支撐,促進(jìn)信息資源的共享從而帶動(dòng)微生物資源的開(kāi)發(fā)和利用,對(duì)微生物資源研究和生物技術(shù)發(fā)展具有重要意義。21?世紀(jì)初,國(guó)際經(jīng)濟(jì)合作與發(fā)展組織(OECD)推動(dòng)建設(shè)全球生物資源中心網(wǎng)絡(luò)(Global Biological Resources Centre Network,GBRCN),歐盟也推動(dòng)過(guò)歐洲生物資源及信息共享項(xiàng)目(Common Access to Biological Resources and Information,CABRI),但是這些計(jì)劃由于缺乏共享機(jī)制和技術(shù)力量支持等原因,都沒(méi)能建立一個(gè)穩(wěn)定運(yùn)行的、成熟的國(guó)際性數(shù)據(jù)平臺(tái)。

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