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高通量種子切片技術(shù)
分子標(biāo)記輔助選擇育種是利用分子標(biāo)記與目標(biāo)性狀基因緊密連鎖的特點(diǎn),從育種群體中篩選具有目的性狀的個(gè)體,可有效減少育種個(gè)體數(shù)量,縮短育種周期,從根本上解決了傳統(tǒng)育種性狀鑒定不準(zhǔn)確、成本高和周期長(zhǎng)的問(wèn)題。在?21?世紀(jì)初,國(guó)際種業(yè)公司如孟山都、先鋒公司等已經(jīng)采用新一代的單核苷酸多態(tài)性(SNP)分子標(biāo)記檢測(cè)技術(shù),它具有檢測(cè)快速、成本低、通量大的特點(diǎn)。隨著分子檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展和育種規(guī)模的擴(kuò)大,群體取樣已經(jīng)成為分子標(biāo)記輔助選擇育種的瓶頸。田間葉片取樣存在著效率低、易出錯(cuò)的問(wèn)題,并且在田間種植的育種群體中有?80%?以上植株在苗期被丟棄,嚴(yán)重地浪費(fèi)了育種資源。在播種前,利用種子切片技術(shù)對(duì)種子進(jìn)行微量取樣,通過(guò)分析樣品可獲得種子的遺傳信息,而后將所期望基因型的種子種植于田間,這樣則大大縮小了群體種植規(guī)模。
自動(dòng)種子切片技術(shù)與高通量分子檢測(cè)技術(shù)相結(jié)合,已經(jīng)形成一種新的育種模式,從而可從數(shù)萬(wàn)籽粒中選出最優(yōu)的一粒參與育種,使育種效率和規(guī)模成倍提高。規(guī)模化育種群體產(chǎn)生的種子數(shù)量巨大,而其中的優(yōu)質(zhì)種子極少,這就要求種子切片機(jī)自動(dòng)化程度高,能從大量的種子中分離出單粒種子;然后對(duì)單粒種子逐一進(jìn)行準(zhǔn)確識(shí)別和特定部位精確切割,以保證后期種子較高的成活率;最后對(duì)取得的微量樣品和切片后的種子準(zhǔn)確無(wú)誤地進(jìn)行一一對(duì)應(yīng)收集,以保證通過(guò)樣品獲得的基因型和種子相對(duì)應(yīng)。
一個(gè)典型的全自動(dòng)種子切片設(shè)備主要包括自動(dòng)供料裝置、種子方向識(shí)別裝置、種子抓取轉(zhuǎn)移裝置、取樣裝置、樣品收集裝置以及控制和信息管理系統(tǒng)?6?個(gè)部分(圖?2)。在信息管理控制的指揮下,自動(dòng)供料裝置從批量的種子中分離出單粒種子;再經(jīng)過(guò)種子方向識(shí)別后,調(diào)整種子方向運(yùn)輸至取樣平臺(tái);然后對(duì)種子進(jìn)行精確取樣,收集裝置將樣品和微創(chuàng)種子一一對(duì)應(yīng)進(jìn)行收集。
自動(dòng)供料裝置。自動(dòng)供料裝置將待取樣種子批量裝載,并進(jìn)行單粒種子分離運(yùn)輸至種子識(shí)別平臺(tái)。其最主要的功能是單粒種子分離,主要采用的方法有旋轉(zhuǎn)盤(pán)分離法和振動(dòng)盤(pán)分離法。旋轉(zhuǎn)盤(pán)分離法是通過(guò)圓盤(pán)旋轉(zhuǎn)把其凹槽中的單粒種子從批量種子中分離出來(lái)[7,20,21],但這種方法僅適用于形狀較為規(guī)則、顆粒較大的種子,如玉米和大豆等;而振動(dòng)分離盤(pán)很好地解決了種子外形的問(wèn)題,它利用螺旋轉(zhuǎn)盤(pán)高頻振動(dòng)使批量種子處于單層平面排列狀態(tài),然后通過(guò)轉(zhuǎn)盤(pán)的螺旋轉(zhuǎn)動(dòng)使種子由平面排列變?yōu)榫€(xiàn)性排列,單粒種子逐漸分離出來(lái)(圖?3)。
種子方向識(shí)別裝置。對(duì)單粒種子進(jìn)行方向識(shí)別,以利于隨后操作過(guò)程中種子抓取、定位和精確切割。主流的種子方向識(shí)別方法是通過(guò)計(jì)算種子外形某些特征來(lái)判斷方向。這種方法主要用于形狀規(guī)則且特征明顯的種子,但對(duì)于玉米穗兩端籽粒、秈稻籽粒等外形不規(guī)則或特征不明顯的種子并不適用,而最新的圖像智能識(shí)別技術(shù)可以解決這一問(wèn)題。李廣偉等利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模式識(shí)別工具箱建立的模型,對(duì)玉米種子姿態(tài)識(shí)別準(zhǔn)確率達(dá)?99%?以上,中玉金標(biāo)記利用人工智能識(shí)別技術(shù)對(duì)秈稻籽粒方向進(jìn)行識(shí)別,準(zhǔn)確率達(dá)?99%(內(nèi)部數(shù)據(jù))。先鋒公司在玉米激光切片技術(shù)上采用另一種方式,在種子頂端涂抹鐵基粉,通過(guò)磁性吸附種子頂端直接調(diào)整玉米種子方向。