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中國網(wǎng)/中國發(fā)展門戶網(wǎng)訊 設(shè)計與合成可預(yù)測的生命體,不僅是合成生物學(xué)領(lǐng)域的核心科學(xué)問題,也是工業(yè)、農(nóng)業(yè)、醫(yī)學(xué)等各大領(lǐng)域應(yīng)用的必要前提。合成生命體往往具有高度復(fù)雜性,這決定了其需要海量的工程化試錯性實驗,即需要快速、低成本、多循環(huán)地完成“設(shè)計—構(gòu)建—測試—學(xué)習(xí)”這一閉環(huán)。
例如,合成生物學(xué)研究中一個重要的方向是利用分子元件創(chuàng)建基因線路,并利用這些基因線路重編程細胞,賦予它們新的能力。然而,人工設(shè)計的基因線路很難完全按照預(yù)期工作,往往需要數(shù)周或數(shù)月的時間進行反復(fù)調(diào)諧,這主要是因為人們對基因線路核心設(shè)計原理的理解有限,且目前仍缺乏多元化、表征詳細的優(yōu)質(zhì)元件。應(yīng)對這一難題的最有效手段,是工程化、大批量測試多種元件及多種線路組合,獲取海量實驗數(shù)據(jù)并分析改進。即通過“設(shè)計—構(gòu)建—測試—學(xué)習(xí)”這一閉環(huán),深入掌握基因線路的設(shè)計原理,同時積累大批優(yōu)質(zhì)元件,從而讓合成生物學(xué)的基因線路設(shè)計變得更加直接和可預(yù)測,提高研究效率。
顯然,海量的工程化試錯實驗將遠遠超出傳統(tǒng)的勞動密集型研究范式的能力范疇,因而亟需一種變革性的工程化研究平臺。工程化平臺能夠快速積累經(jīng)驗知識,是實現(xiàn)生命體可預(yù)測合成的科學(xué)基礎(chǔ);在其之上,逐步推廣生物元件、基因線路、代謝途徑、基因組、生物系統(tǒng)乃至多細胞體系的標準化,最終實現(xiàn)對生命體的理性設(shè)計與可預(yù)測的合成。本文將介紹全球合成生物學(xué)研究的一些工程化平臺,及其上下游機構(gòu)的發(fā)展案例、創(chuàng)新機制與趨勢。