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面向生物合成的代謝工程策略設(shè)計(jì)

發(fā)布時(shí)間:2018-11-16 17:16:37  |  來源:中國(guó)網(wǎng)·中國(guó)發(fā)展門戶網(wǎng)  |  作者:馬紅武 陳修來 袁倩倩 劉立明 孫際賓  |  責(zé)任編輯:趙斌宇
關(guān)鍵詞:計(jì)算設(shè)計(jì),代謝工程,生物合成,動(dòng)態(tài)調(diào)控,代謝網(wǎng)絡(luò),合成生物學(xué)

圖1由代謝網(wǎng)絡(luò)分析確定聚3-羥基丁酸酯(P3HB)合成最優(yōu)途徑

(a)常規(guī)途徑由于丙酮酸脫氫步驟的碳損失1個(gè)葡萄糖(6個(gè)碳原子)只能生成1個(gè)P3HB(4個(gè)碳原子),碳摩爾得率為0.67;(b)通過代謝網(wǎng)絡(luò)模型計(jì)算得到新途徑通過蘇氨酸循環(huán)由1個(gè)葡萄糖得到1.28個(gè)P3HB,碳摩爾得率提高到0.85。新途徑的實(shí)現(xiàn)可顯著降低原料成本

外源基因的引入不但可以使細(xì)胞從無到有獲得合成新產(chǎn)品的能力,也可以形成新的途徑提高已有產(chǎn)品的得率。Bogorad?等通過在大腸桿菌中引入來源于?B. adolescentis?的戊糖/己糖磷酸轉(zhuǎn)酮酶(Fxpk)構(gòu)建了非氧化酵解途徑(non-oxidative glycolysis,NOG)。通過該途徑可以實(shí)現(xiàn)?1?個(gè)葡萄糖生成?3?個(gè)乙酸,即完全沒有碳損失(圖?2)。我們?cè)诖竽c桿菌?iJO1366?模型中引入該反應(yīng)后通過?FBA?分析對(duì)上百種生物產(chǎn)品的理論得率進(jìn)行了計(jì)算,發(fā)現(xiàn)至少有幾十種生化產(chǎn)品的得率都有了顯著提高。在這一計(jì)算結(jié)果指導(dǎo)下,構(gòu)建了含?NOG?途徑的大腸桿菌菌株并分別用于?P3HB、丙酮和異丙醇的生產(chǎn)。改造后的菌株與出發(fā)菌株相比得率均有顯著提高。最近?Meadows?等將?NOG?途徑引入到釀酒酵母細(xì)胞中構(gòu)建了法尼烯合成細(xì)胞工廠,最終菌株法尼烯對(duì)葡萄糖的碳摩爾得率由?0.52?提高到?0.65。

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