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符合工程化需求的生物元件設計

發(fā)布時間:2018-11-16 17:17:24  |  來源:中國網(wǎng)·中國發(fā)展門戶網(wǎng)  |  作者:崔穎璐 吳邊  |  責任編輯:趙斌宇
關鍵詞:酶分子計算設計,酶工程,人工金屬酶,底物選擇性,熱穩(wěn)定性

人工金屬催化酶設計

金屬酶在原子轉移反應中占有重要地位。自?21?世紀初開始,人工金屬酶設計迅速發(fā)展,并從水解反應等天然催化反應擴展至碳-碳鍵連接、氧轉移反應等非天然酶催化原子轉移反應。例如,上述的?Diels-Alder?反應中,人工金屬酶催化?Diels-Alder?反應的立體選擇性和反應活性已與化學催化劑相當。此外,相對于天然酶,金屬酶的底物范圍明顯增大。2011?年,Kuhlman?課題組偶然發(fā)現(xiàn),在同源二聚體界面處計算設計的?Zn(Ⅱ)?結合位點可有效催化羧酸酯和磷酸酯水解。隨后,他們在?rabenosyn?蛋白的?Rab4?結合域引入組氨酸與?Zn(Ⅱ)?配位,該復合體對?4-?硝基苯基乙酸酯的水解速率提升了?5?個數(shù)量級。除了活性位點結構優(yōu)化外,化學連接法也是人工金屬酶設計的可行策略。Rovis?課題組讓生物素?Rh(Ⅲ)?配位復合物與鏈霉親和素結合,構建出用于活化?C-H?鍵的人工金屬酶,催化速率提升了100?倍,并具有?93%?的對映選擇性。此外,正如?Alexandrova?課題組在綜述中所述,金屬酶進化過程除了受反應活性等因素影響外,還受金屬可用性和毒性影響。在這些限制因素下,金屬催化劑并非一定達到其最佳催化性能。因此,利用新型金屬代替固有金屬催化劑改善酶的催化性質(zhì)為金屬酶分子設計提供了新思路。Itoh?和?Fujieda在分子動力學模擬的基礎上,利用銅離子取代?β-?內(nèi)酰胺酶的雙鋅離子結合部分,制備了人工雙銅氧化酶。與野生型?β-?內(nèi)酰胺酶相比,這種銅取代氧化酶的三重突變體催化?4-?叔丁基羧酸酯的?kcat/KM值增加了?87?倍。

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