(一)2009年，財政部代編160個項目預(yù)算1702.83億元，代編預(yù)算規(guī)模仍較大。
(二)財政部批復(fù)的中央部門年初預(yù)算中，有財政撥款之外的基本支出1793.05億元未細(xì)化到人員經(jīng)費和日常公用經(jīng)費；有27個項目支出170.20億元、6項政府性基金支出59.40億元未落實到具體項目或單位，其中三峽工程建設(shè)基金等4項政府性基金只列了預(yù)算支出總額。
(三)基本支出定員定額改革從2001年開始試點，目前中央財政尚未建立完善的定員定額體系，不利于規(guī)范預(yù)算分配和執(zhí)行。
(四)在衛(wèi)生部所屬的15家醫(yī)院2007年和2008年修購基金年末結(jié)余分別為45.15億元、49.99億元的情況下，財政部2009年仍安排其新建固定資產(chǎn)等項目預(yù)算16.39億元，這不利于統(tǒng)籌安排資金，提高資金使用效益。
(五)發(fā)展改革委等5部門2009年1月下達(dá)天津、河北等6省區(qū)市2008年鞏固退耕還林成果任務(wù)計劃35.58億元，財政部2009年6月才撥付資金，影響預(yù)算執(zhí)行進(jìn)度。
(六)2009年12月，中央本級庫款支出為2166.53億元，是前11個月平均數(shù)的1.87倍，占全年支出的14.2%，預(yù)算執(zhí)行進(jìn)度不夠均衡。
(七)2009年，中央財政本級實際支付以前年度結(jié)轉(zhuǎn)資金1343.10億元，1至11月實際支付時均記列為當(dāng)年預(yù)算支出，年末再一次性調(diào)減，使財政部向社會公布的1至11月中央本級財政支出數(shù)據(jù)不夠準(zhǔn)確。
(八)2009年，發(fā)展改革委向尚未取得初步設(shè)計批復(fù)的中國鐵道科學(xué)研究院城市軌道交通試驗線等2個項目、未取得環(huán)境影響評價審批意見或征地手續(xù)的無錫國家大型渦輪葉片研發(fā)和檢測中心等3個項目、未完成評估論證的蘭州國家石油儲備基地工程等下達(dá)投資計劃共計6.37億元。截至2010年3月，上述項目均未開工建設(shè)，資金全部閑置。
(九)發(fā)展改革委在下達(dá)重點產(chǎn)業(yè)振興和技術(shù)改造中央預(yù)算內(nèi)投資計劃時，將4.72億元下達(dá)給了不屬于該專項范圍的22個建材項目和50個醫(yī)藥項目。
(十)2009年，發(fā)展改革委下達(dá)重點流域水污染治理項目中央預(yù)算內(nèi)投資計劃30億元，涉及314個項目。抽查其中124個項目發(fā)現(xiàn)，實際投資補(bǔ)助標(biāo)準(zhǔn)存在較大差異，同流域同省份實際補(bǔ)助標(biāo)準(zhǔn)不一致的項目有60個，涉及11個省，如陜西省8個項目的實際補(bǔ)助標(biāo)準(zhǔn)最高為30%、最低僅4.3%。
(十一)因相關(guān)建設(shè)單位前期準(zhǔn)備不充分等，截至2010年3月底，發(fā)展改革委下達(dá)的2009年農(nóng)網(wǎng)完善工程等中央預(yù)算內(nèi)投資計劃79.79億元中，有32.03億元國家電網(wǎng)公司尚未向財政部申請使用，占40.14%；有11.03億元滯留在省級電網(wǎng)公司未用。
(十二)截至2009年底，發(fā)展改革委向國家文化和自然遺產(chǎn)地保護(hù)、搶救性文物保護(hù)設(shè)施建設(shè)等2個專項下達(dá)的中央投資分別占“十一五”規(guī)劃項目任務(wù)的37.5%和52.36%。若按此投資進(jìn)度，在規(guī)劃期內(nèi)很難完成建設(shè)。
(十三)審計18個省中等職業(yè)教育基礎(chǔ)能力建設(shè)和農(nóng)村初中校舍改造兩個專項的437個項目發(fā)現(xiàn)，發(fā)展改革委把關(guān)不夠嚴(yán)格，向地方申報材料不真實的項目下達(dá)中央預(yù)算內(nèi)投資5154萬元，其中2081.21萬元被挪用于償還欠款或其他項目建設(shè)。由于前期準(zhǔn)備不足、選址變更和配套設(shè)施不全等，截至2009年底，有13個項目未開工、9個項目建成后閑置，涉及中央投資5382萬元。一些地方還存在轉(zhuǎn)嫁配套責(zé)任等問題，有12個項目的1301萬元配套資金被轉(zhuǎn)嫁給下級政府和學(xué)校，另有4所學(xué)校向職工個人有償集資1445.4萬元。
(十四)審計18個直屬海關(guān)關(guān)稅和進(jìn)口環(huán)節(jié)稅征管情況發(fā)現(xiàn)，截至2009年底，有11個海關(guān)對進(jìn)口貨物完稅價格、適用稅率以及減免稅等審核把關(guān)不嚴(yán)，造成稅款流失3664.55萬元；有6個海關(guān)對13戶企業(yè)擅自將尚在海關(guān)監(jiān)管期內(nèi)的免稅進(jìn)口貨物移作他用的行為，未按規(guī)定要求企業(yè)補(bǔ)稅或提供稅收擔(dān)保，涉及減免稅款7.75億元，存在稅款流失隱患。此外，天津海關(guān)為調(diào)節(jié)收入進(jìn)度，對22家企業(yè)2009年12月申報的進(jìn)口貨物，在符合征稅條件的情況下，先以各種理由征收稅款保證金8.01億元，在2010年1月才轉(zhuǎn)為稅款入庫。
對上述問題，財政部、發(fā)展改革委和有關(guān)部門正在逐項研究，加以整改。
二、中央部門預(yù)算執(zhí)行審計情況
此次共審計56個中央部門，延伸審計310個所屬單位；審計預(yù)算支出1224.83億元，占這些部門預(yù)算支出總額的33.23%。2009年，這些部門重視和加強(qiáng)預(yù)算管理，不斷完善財務(wù)管理制度，加大對財政資金使用的監(jiān)督力度，在審計前對其本級和所屬912個單位進(jìn)行了自查，還有24個部門制定和完善了117項規(guī)章制度。審計結(jié)果表明，部門預(yù)算的執(zhí)行力與約束力有所增強(qiáng)，預(yù)算管理水平有所提高，違紀(jì)違規(guī)問題明顯減少。但預(yù)算執(zhí)行和預(yù)算管理中也存在一些問題：
一是預(yù)算執(zhí)行還不完全到位。56個部門中，有16個部門當(dāng)年超預(yù)算支出8.74億元，占這些部門預(yù)算支出的3.38%，主要是動用以前年度財政撥款結(jié)余等未編入本年預(yù)算，還有個別部門因人員經(jīng)費定額偏低而使用其他經(jīng)費彌補(bǔ)，造成實際支出超預(yù)算；有40個部門年末預(yù)算結(jié)余161.26億元，占這些部門預(yù)算支出的16.69%，主要是一些部門的項目庫建設(shè)滯后，項目論證不夠充分，年初預(yù)算未按要求落實到具體項目，有的預(yù)算資金下達(dá)晚，造成預(yù)算執(zhí)行進(jìn)度慢，當(dāng)年項目預(yù)算沒有完成而形成結(jié)轉(zhuǎn)資金。
二是預(yù)算管理還不夠嚴(yán)格和規(guī)范。56個部門中，有16個部門存在以撥代支等問題，涉及金額5.60億元；19個部門存在未嚴(yán)格執(zhí)行政府采購規(guī)定的問題，涉及金額14.09億元；23家受托代征單位未按規(guī)定征收或上繳港口建設(shè)費50.85億元。
三是一些部門及所屬單位仍存在違反財經(jīng)制度規(guī)定的問題，涉及金額34.84億元，具體是：
1.擠占挪用財政資金和違規(guī)發(fā)放津貼補(bǔ)貼10.95億元。其中：35個部門本級和83個所屬單位因項目預(yù)算編制不夠細(xì)化、執(zhí)行不嚴(yán)格等，造成擠占和挪用預(yù)算資金9.22億元；兩個部門本級和25個所屬單位未嚴(yán)格執(zhí)行國家有關(guān)規(guī)定，新增項目或提高標(biāo)準(zhǔn)發(fā)放津貼補(bǔ)貼1.73億元。
2.多申領(lǐng)財政資金或瞞報收入和資產(chǎn)等6.21億元。其中：1個部門本級和6個所屬單位采取虛報或重復(fù)申報項目等方式，多申領(lǐng)財政資金2962.68萬元；14個部門本級和33個所屬單位瞞報各項收入和資產(chǎn)等5.91億元，未在法定賬簿內(nèi)核算。
3.違規(guī)收費及未按規(guī)定征繳非稅收入等16.26億元。其中：1個部門本級和17個所屬單位違規(guī)收費或攤派等2.44億元；3個部門本級和10個所屬單位未按規(guī)定征收和上繳非稅收入13.82億元。
4.接受和使用虛假發(fā)票列支問題比較普遍。抽查56個中央部門已報銷的29363張可疑發(fā)票中，有5170張為虛假發(fā)票，列支金額為1.42億元。其中：8個部門本級和34個所屬單位在無真實經(jīng)濟(jì)業(yè)務(wù)背景的情況下，利用虛假發(fā)票套取資金9784.14萬元，主要用于發(fā)放職工福利補(bǔ)貼等；12個部門本級和37個所屬單位對票據(jù)審核把關(guān)不嚴(yán)，接受虛假發(fā)票報賬4456.66萬元。
四是部門決算(草案)編報不夠準(zhǔn)確。在決算(草案)審計中發(fā)現(xiàn)，有49個部門決算(草案)反映的收入、支出、結(jié)余不夠準(zhǔn)確、資產(chǎn)不夠完整，涉及金額25.21億元，占報表反映資金總量的0.70%。對這些問題，審計長已簽署意見，要求被審計單位在財政部批復(fù)決算前調(diào)整相關(guān)賬目和報表。
目前，中央部門已糾正自查中發(fā)現(xiàn)的各類問題54.40億元，整改審計中發(fā)現(xiàn)的問題2.94億元，并制定了91條落實審計建議的具體措施。
各部門的審計結(jié)果將依法予以公告。
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